摩托車駕駛證和汽車駕駛證合并后，扣分會在這張合并后的證件上扣分，可以說是在摩托車駕駛證和汽車駕駛證上都要扣分。總共還有12分。不管違章開什么車，還是要扣12分的。一旦扣12分以上，摩托車或汽車的主駕駛人必須重新驗證，否則不能上路行駛。以下是擴展信息： 相關規(guī)定：公安機關交通管理部門除依法實施行政處罰外，對機動車駕駛人違反道路交通安全法律法規(guī)行為實行累積記分制度。公安機關交通管理部門對累計記分達到規(guī)定分數(shù)的機動車駕駛人，應當扣留機動車駕駛證，對其進行道路交通安全法律法規(guī)教育，并重新審驗。