汽車(chē)登記證書(shū)丟失辦理的流程如下：

首先，車(chē)主準(zhǔn)備好所需資料，包括機(jī)動(dòng)車(chē)所有人身份證明原件和復(fù)印件、《機(jī)動(dòng)車(chē)牌證申請(qǐng)表》、機(jī)動(dòng)車(chē)查驗(yàn)記錄表。如果是單位的車(chē)，還需提供單位的統(tǒng)一社會(huì)信用代碼證原件及復(fù)印件，加蓋公章的委托書(shū)，經(jīng)辦人身份證原件及復(fù)印件（暫住人口還需居住證原件及復(fù)印件）。

然后，車(chē)主開(kāi)車(chē)到車(chē)輛注冊(cè)地車(chē)管所及各服務(wù)站申請(qǐng)辦理。車(chē)輛通過(guò)專(zhuān)門(mén)的查驗(yàn)通道，直接到查驗(yàn)點(diǎn)進(jìn)行查驗(yàn)。車(chē)管所工作人員對(duì)車(chē)輛查驗(yàn)完成后，車(chē)主到查驗(yàn)服務(wù)處確認(rèn)信息。

接著，車(chē)主到業(yè)務(wù)大廳導(dǎo)辦服務(wù)臺(tái)裝訂手續(xù)，排隊(duì)等待辦理。裝訂手續(xù)后，在等候區(qū)等待叫號(hào)辦理業(yè)務(wù)，到對(duì)應(yīng)窗口進(jìn)行辦理。攜帶受理憑證到收費(fèi)窗口交費(fèi)。

最后，車(chē)主到取證窗口打印機(jī)動(dòng)車(chē)登記證書(shū)，補(bǔ)辦完成。

需要注意的是，根據(jù)《機(jī)動(dòng)車(chē)登記規(guī)定》第 124 號(hào)令第五十四條規(guī)定，機(jī)動(dòng)車(chē)所有人可以委托代理人代理申請(qǐng)各項(xiàng)機(jī)動(dòng)車(chē)登記和業(yè)務(wù)，但申請(qǐng)補(bǔ)領(lǐng)機(jī)動(dòng)車(chē)登記證書(shū)的除外。特殊情況是機(jī)動(dòng)車(chē)所有人因死亡、出境、重病、傷殘或者不可抗力等原因不能到場(chǎng)申請(qǐng)補(bǔ)領(lǐng)機(jī)動(dòng)車(chē)登記證書(shū)的，可以憑公證機(jī)關(guān)公證過(guò)的相關(guān)證明和機(jī)動(dòng)車(chē)所有人書(shū)面委托，委托代理人代理申領(lǐng)。